แร่ธาตุเป็นองค์ประกอบที่สำคัญในโครงสร้างเปลือก การปรับสมดุลเกลือและน้ำ และการดำรงชีพของกุ้ง แร่ธาตุที่สำคัญ ได้แก่ แคลเซียม (Ca), แมกนีเซียม (Mg), โซเดียม (Na), โปตัสเซียม (K) และคลอไรด์ (Cl)
บางบ่อปล่อยกุ้งค่อนข้างหนาแน่น มีปัญหาน้ำขุ่น หนืด ไม่มีการถ่ายเทน้ำ หรือบำบัดคุณภาพน้ำที่ดีพอ เกิดการสะสมของเสียในบ่อเลี้ยง ค่าpH ของน้ำไม่คงที่
การจัดการคุณภาพน้ำในบ่อเลี้ยงกุ้งและปลา จัดเป็นปัญหาที่ค่อนข้างยุ่งยาก เพราะผู้เลี้ยงกุ้งและปลาจะต้องมีความรู้ความเข้าใจถึงการเปลี่ยนแปลงต่าง ๆ ที่เกิดขึ้น เพื่อหาแนวทางในการป้องกันและแก้ไขปัญหาที่อาจมีผลต่อสุขภาพและการเจริญเติบโตของกุ้งและปลา
